Škocjanski zatok (tal. Val Stagnon, prije Škocjanski zaliv), bočata laguna na istočnom rubu grada Kopra. Važan životni prostor močvarnih ptica (Ramsarska konvencija) i zajednica raslinja u slanom okolišu. 

Od najugroženijih ptica tu prebivaju crnokljuni blatarić (Charadrius alexandrinus), mala čaplja (Ixobrychus minutus) i crvenonoga vlastelica (Himantopus himantopus), a od habitatnih vrsta ponajprije rod Salicornia te sredozemni slani travnjaci (Juncetalia maritimi). Slovenski parlament zakonom je 1988. područje proglasio prirodnim rezervatom.